西五马路基督教堂始建于1886年（清光绪十二年）。这座百年圣殿，见证了基督教在长春的传播，也承载着中国基督徒爱国爱教、服务社会的传统。2012年5月获评吉林省宗教界爱国主义教育基地，2013年12月列入全国第二批宗教界爱国主义教育基地。
英国基督教长老会派遣牧师傅多玛等赴长春，于南关区西五马路615号创立教会，开启基督教在长春的传播。1888年举行首次信徒洗礼。1893年，纪礼备牧师主持修建牧师府，并创办教会医院与西三道街福音堂。1907年创办萃文学校（今西五马路小学）。1922年按立首位中国籍牧师陈明善。
1900年义和团运动波及长春，部分教会建筑受损，事后迅速恢复。至1948年长春解放前，长春基督教已有8个宗派，建立教区、教会学校、施医院等机构60余处，信徒约2000人，辐射市区及榆树、农安等外五县。东北沦陷期间，各宗派教会达29处，信徒2428人。
中国基督教发起自治、自养、自传的三自爱国运动，长春教会积极响应，彻底与西方差会脱离关系。1951年正式登记为“中华基督教长春西五马路教会”，并成立三自革新筹备委员会。1957年全市各宗派实现联合礼拜。1966至1979年活动一度中断，1979年12月25日正式恢复。
1980年市政府落实宗教政策，拨款修缮教堂并重启礼拜。1990年扩建330平方米小礼拜堂。1997年原礼拜堂因危房拆除，信徒捐资重建高46米的爱尔兰风格主堂，1998年6月献堂启用。
2010年翻新主堂，并增建2200平方米综合楼及附属设施。同年12月，西五马路基督教堂获评“首届全国创建和谐寺观教堂先进集体”。今日之教会，巍然矗立于西五马路，以钟声传递和平，续写荣神益人的使命。